Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYCE3A1L190 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCE3A1L190 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms