Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8H2

KRTAP5-3, Keratin-associated protein 5-3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP5-3Q6L8H2 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 PPP6C-202ENST00000415905 4172 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF888-202ENST00000638862 4195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 FBXL19-AS1-201ENST00000563777 3951 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 AC097637.1-201ENST00000494383 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 EXD2-201ENST00000312994 5107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 RFX2-202ENST00000359161 3595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 CRB1-210ENST00000538660 3397 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 AL442125.1-201ENST00000619092 3362 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 AC007608.4-201ENST00000623140 3365 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 PRICKLE1-213ENST00000639589 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 LRGUK-201ENST00000285928 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 CYFIP1-207ENST00000617556 5674 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 ARPP21-207ENST00000417925 3086 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 SCML2-201ENST00000251900 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 HIVEP1-201ENST00000379388 9027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 HIVEP1-208ENST00000541134 9023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 MTF2-214ENST00000545708 4046 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 KCNA2-203ENST00000485317 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 NBPF6-202ENST00000495380 2494 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 SEC23B-204ENST00000377475 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 STX16-204ENST00000359617 4273 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 TRPV3-201ENST00000301365 3235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 FAM13B-202ENST00000420893 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 RAD17-213ENST00000509734 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 TOPORS-201ENST00000360538 4098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 AL353625.1-201ENST00000569097 3131 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 PLEKHH1-201ENST00000329153 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 L1CAM-201ENST00000361699 3888 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 AP003025.2-202ENST00000414466 4335 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 PGK1-201ENST00000373316 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 SUFU-203ENST00000423559 2601 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 ZHX1-206ENST00000522655 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 STRIP1-201ENST00000369795 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 HEATR6-203ENST00000585976 3288 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 HEATR6-212ENST00000613428 3287 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 SCFD2-202ENST00000401642 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 DDR1-227ENST00000376570 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 DAPK1-219ENST00000622514 5772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 GFM1-210ENST00000486715 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 STRADA-201ENST00000245865 2959 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 TBC1D31-202ENST00000327098 2985 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 SNRNP48-201ENST00000342415 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 EXOC7-202ENST00000335146 3519 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF345-206ENST00000529555 3527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 EFTUD2-202ENST00000426333 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 ARHGAP6-205ENST00000380736 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP5-3Q6L8H2 MED24-202ENST00000394126 3896 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.1 ms