Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
U3KQE9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
U3KQE9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
U3KQE9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
U3KQE9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms