Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CAPN6Q9Y6Q1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPN6Q9Y6Q1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms