Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMX5

NENF, Neudesin, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENFQ9UMX5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NENFQ9UMX5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms