Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NKX1-2Q9UD57 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKX1-2Q9UD57 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms