Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM8A1Q9UBU6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms