Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL13Q9P2N7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLHL13Q9P2N7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms