Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP35Q9P2H5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP35Q9P2H5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms