Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MSRB1Q9NZV6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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