Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TVP23BQ9NYZ1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms