Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TDP1Q9NUW8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDP1Q9NUW8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TDP1Q9NUW8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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