Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LMBRD1Q9NUN5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMBRD1Q9NUN5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms