Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNPLA3Q9NST1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PNPLA3Q9NST1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms