Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
SHARPINQ9H0F6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SHARPINQ9H0F6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms