Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRCC1Q9C099 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRCC1Q9C099 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRCC1Q9C099 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRCC1Q9C099 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRCC1Q9C099 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRCC1Q9C099 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRCC1Q9C099 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRCC1Q9C099 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRCC1Q9C099 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRCC1Q9C099 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRCC1Q9C099 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRCC1Q9C099 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRCC1Q9C099 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms