Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
MAP1LC3CQ9BXW4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms