Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC32Q9BV29 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC32Q9BV29 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms