Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms