Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC9Q96Q05 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC9Q96Q05 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms