Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NLRP3Q96P20 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms