Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
YTHDC1Q96MU7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
YTHDC1Q96MU7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms