Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CELF6Q96J87 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CELF6Q96J87 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms