Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC107Q8WV48 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms