Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms