Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HAVCR2Q8TDQ0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HAVCR2Q8TDQ0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms