Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF397Q8NF99 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF397Q8NF99 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms