Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PIK3C3Q8NEB9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms