Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC63Q8NA47 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms