Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSIP1Q8NA03 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms