Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FUNDC1Q8IVP5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms