Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRADAQ7RTN6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
STRADAQ7RTN6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms