Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTOP1Q7RTM1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms