Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C12orf54Q6X4T0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C12orf54Q6X4T0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms