Protein–RNA interactions for Protein: Q6VAB6

KSR2, Kinase suppressor of Ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR2Q6VAB6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KSR2Q6VAB6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KSR2Q6VAB6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms