Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCBE1Q6UXH8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms