Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ZBED9Q6R2W3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED9Q6R2W3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
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