Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SHEQ5VZ18 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms