Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF3Q5VWG9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF3Q5VWG9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms