Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AGAP6Q5VW22 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AGAP6Q5VW22 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms