Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RTL8BQ17RB0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RTL8BQ17RB0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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