Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GABRA6Q16445 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GABRA6Q16445 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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