Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SEMA3AQ14563 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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