Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL9A2Q14055 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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COL9A2Q14055 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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COL9A2Q14055 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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COL9A2Q14055 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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COL9A2Q14055 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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COL9A2Q14055 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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COL9A2Q14055 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COL9A2Q14055 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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