Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MSLNQ13421 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSLNQ13421 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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