Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NR1H3Q13133 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms