Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CSTF3Q12996 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSTF3Q12996 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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