Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KIF5AQ12840 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KIF5AQ12840 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms