Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMOD3Q0VAK6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMOD3Q0VAK6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms