Protein–RNA interactions for Protein: Q08426

EHHADH, Peroxisomal bifunctional enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHHADHQ08426 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EHHADHQ08426 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EHHADHQ08426 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms